由CRC出版社出版、Hinrich Gohlmann和Willem Talloen編寫的《基於Affymetrix芯片的基因表達研究》一書，是作者根據十餘年的基因表達譜實驗研究和數據分析的實踐經驗編寫的。Hinrich Gohlmann和Willem Talloen分別是強生藥品研發有限公司(Johnson & Johnson Pharmaceutical R & D)的首席科學家和**生物統計師。作為分子生物學和生物統計方面的專家，他們從理論概念到實驗結果，解釋了使用Affymetrix芯片進行基因表達研究的全部過程。

Affymetrix GeneChip繫統是目前應用最廣泛的生物芯片平臺。但是由 於Affymetrix芯片含有超大量的信息，很多Affymetrix芯片用戶趨向於使 用默認的分析設置，得到的常常不是最優化的結論。分子生物學家和生物 統計學家根據十餘年的基因表達譜實驗研究和數據分析的實踐經驗編寫了 《基於Affymetrix芯片的基因表達研究》，從理論概念到實驗結果，解釋 了使用Affymetrix芯片進行基因表達研究的全部過程，拆除了分子生物學 、生物信息學和生物統計學之間無處不在的語言障礙。 《基於Affymetrix芯片的基因表達研究》權威實用，介紹了 Affymetrix芯片的重要技術、統計學易犯的錯誤和問題，同時涉及其他芯 片平臺的一般規則和應用。通過例證和全彩圖例，描述了技術和統計方法 的概念，為初學者提供詳細指導。本領域的專家則可以了解芯片所涉及的 其他學科知識，拓展基因芯片表達譜研究的認識。本書由Hinrich Gohlmann和Willem Talloen編寫。

附圖目錄
表格目錄
BioBox目錄
StatsBox目錄
前言
縮寫詞和術語
1 生物學問題
1.1 為什麼進行基因表達？
1.1.1 生物技術的進展
1.1.2 生物學相關的研究
1.2 研究問題
1.2.1 相關性和實驗研究對比
1.3 研究課題的主要類型
1.3.1 兩組間比較
1.3.2 多組間比較
1.3.3 不同治療方式間的比較
1.3.4 多組與對照組的比較
1.3.5 研究主題內的變化
1.3.6 分類和預測樣本
2 Affymetrix芯片技術
2.1 探針
2.2 探針組
2.2.1 標準探針組的定義
2.2.2 客戶可選擇的芯片描述文件(CDF)
2.3 芯片類型
2.3.1 標準表達檢測芯片
2.3.2 外顯子芯片
2.3.3 基因芯片
2.3.4 疊瓦芯片
2.3.5 用於某項研究的專用芯片
2.4 標準實驗室芯片實驗流程
2.4.1 體外轉錄分析
2.4.2 全轉錄本正義鏈標記
2.5 Affymetrix芯片的數據質量
2.5.1 分析數據的重復性
2.5.2 分析數據的穩定性
2.5.3 分析的敏感性
3 實驗操作
3.1 生物學實驗
3.1.1 生物學背景
3.1.1.1 實驗目的/假設
3.1.1.2 技術平臺
3.1.1.3 mRNA水平的預期改變
3.1.2 樣本
3.1.2.1 選擇合適的樣品/組織
3.1.2.2 樣本的類型
3.1.2.3 樣本的異質性
3.1.2.4 性別
3.1.2.5 時間點
3.1.2.6 樣本切割引起的誤差
3.1.2.7 動物處理產生的誤差
3.1.2.8 RNA的質量
3.1.2.9 RNA的數量
3.1.3 預實驗
3.1.4 主實驗
3.1.4.1 對照實驗
3.1.4.2 實驗處理
3.1.4.3 分批實驗
3.1.4.4 隨機化
3.1.4.5 標準化
3.1.4.6 選擇對照
3.1.4.7 樣品量／重復次數／費用
3.1.4.8 平衡設計
3.1.4.9 對照樣本
3.1.4.10 樣本混合
3.1.4.11 實驗記錄
……
4 數據分析預處理
5 數據分析
6 分析結果表示
7 藥物研發
8 使用R和Bioconductor
9 未來前景
參考文獻
索引