堂本一輝是**的鋼琴演奏家，兩年前突然宣布不再演奏鋼琴轉而攻向管風琴，*斥資建造了堂本音樂廳，準備在落成之日舉行演奏會。柯南等一行人，也受到了這位鋼琴家的邀請。
然而在演奏會之前，堂本音樂學院的學生相繼死去，先是**案，後是單個被殺。連演奏會邀請的天纔女高音歌唱家秋庭也開始遭遇到一繫列的危險：潤生茶被下藥、遭遇空氣*襲擊、試演會當天*遭擊暈……
究竟是音樂學院的內鬼，還是兇手另有其人，他的目的為何？殺人動機又是什麼？柯南究竟如何找到兇手，如何找到有力的證據，危險步步逼近……

柯南一行應邀參加由鋼琴家建造的音樂廳的落成音樂會。但是，卻發 生了以音樂會的主演——天纔女歌手為目標的事件！！ 這和最近發生的原鋼琴家學生接二連三被殺害的連續殺人事件有什麼 關繫嗎…… 被演奏出的惡意的旋律，柯南能不能解讀出它的曲譜呢？！