郭水良、於晶、陳國奇編著的《生態學數據分析--方法程序與軟件》主要介紹群落生態學研究中的數據轉換、標準化、數據間關繫的函數擬合、生態位、物種和遺傳多樣性、空間分布格局、聚類、排序、結果圖形表達，以及實驗生態學中的數據統計檢驗有關的方法。書中涉及的軟件有PCORD for Windows 4．1、Canoco forWindows、CurveExpert 1．3和PAST 2．17等。同時應用QBASIC和R語言對書中的一些方法編寫程序。每一種方法均提供模擬數據，並進行具體操作步驟的介紹。
對於大多數生態學數據處理方法，本書並沒有介紹它們深奧的數學原理和復雜的公式推導，而是將重點放在相關軟件、程序的使用方法上，盡量做到圖文並茂，清晰明了。每一種方法均提供模擬數據和主要結果的說明。讀者隻要根據書中的方法，按部就班，就能夠完成數據的處理。

生態學研究需要從原始數據出發，通過繫列汁算 分析，最後作出具有生態意義的解釋。郭水良、於晶 、陳國奇編著的《生態學數據分析--方法程序與軟件 》主要介紹PCORD for Windows、Canoco for Windows、CurveExpert、SPSS和IPAST等軟件在生念 學數據轉換、標準化、函數擬合、遺傳多樣性、物種 多樣性、生態位、空間分布格局、聚類、排序和實驗 數據統汁檢驗上的應用方法。應用QBASIC和R語言對 書中的部分方法編制程序。書中的每一種方法均提供 模擬數據，介紹具體的操作步驟。 本書可作為高等院校生態學、環境科學、水生生 物學、植物學及其相關專業的研究生教材也可以作為 上述領域的科研和技術人員的工具書。

前言
第一章 生態學數據收集
第一節 樣方設置
一、主觀取樣
二、客觀取樣
第二節 樣方形狀、大小和數目
一、樣方的形狀
二、樣方的大小
三、樣方的數目
第三節 無樣地取樣法
第二章 群落數量和環境特征
第一節 群落的數量特征
一、多度
二、密度
三、蓋度
四、頻度
五、高度
六、生物量和產量
七、優勢度和生態重要值
八、生活型
九、種一面積曲線和群落*小面積
第二節 環境特征
一、氣候數據
二、地形數據
三、土壤數據
四、水體環境
五、生物因子數據
第三章 數據準備
第一節 數據的類型
一、名稱數據
二、順序性數據
三、數量數據
四、數據矩陣
第二節 數據預處理
一、數據簡縮
二、數據轉換
三、數據標準化
第三節 QBASIC編程
第四章 回歸分析
第一節 應用Curvet：xpert進行函數擬合
一、CurveExpert軟件簡介
二、操作步驟
第二節 應用SPSS進行曲線擬合
第三節 運用Excel電子表格進行變量關繫擬合
第四節 多元線性回歸
第五章 多樣性指數計算
第一節 生物多樣性概述
第二節 遺傳多樣性
一、取樣方法
二、遺傳多樣性標記介紹
三、分子數據分析方法
四、應用Popgen32計算群體遺傳多樣性和分化
第三節 物種多樣性
一、物種多樣性的概念
二、a物種多樣性計算公式
三、β物種多樣性計算公式
四、物種多樣性的計算程序和軟件
第六章 種間關繫分析
第一節 相關分析
一、連續數據的相關性分析
二、二元數據的雙繫列相關繫數
第二節 種間關聯
第三節 種間相關
一、Pearson相關繫數
二、Spearman秩相關繫數
三、應用SPSS計算Pearson和Spearman秩相關繫數
四、應用PAST計算Pearson相關繫數和Spearman秩相關繫數
五、應用QBASIC程序計算變量之間的相關性
第七章 生態位
第一節 生態位概念
第二節 生態位指數計算
一、生態位寬度
二、生態位重疊值
第八章 空間格局分析
第一節 空間格局的概念
第二節 分布格局類型的判定方法
一、方差均值比
二、X2檢驗
三、ψ檢驗
四、Morisita指數
五、CA擴散指數
六、平均擁擠度
第三節 格局分析方法
一、單種格局規模分析
二、種群分布格局的斑塊間隙、斑塊大小分析
第九章 群落數量分類方法
第一節 分類的目的和意義
第二節 相似繫數和相異繫數
一、僅適合二元數據的相似關繫
二、適用於二元數據和數量數據的相似關繫
第三節 等級聚類方法
一、等級聚類的一般步驟
二、應用PCORD軟件進行聚類分析
三、應用PAST軟件進行聚類分析
四、應用SPSS進行聚類分析
第四節 等級劃分法
一、單元劃分法，
二、雙向指示種分析法
第五節 非等級分類方法
一、相似分類法
二、相異分類法
三、圖論聚類法
第十章 排序
第一節 排序概述
第二節 極點排序
一、方法簡介
二、應用PCORD進行極點排序
第三節 主成分分析
一、主成分分析概述
二、主成分分析的原理
三、計算步驟
四、應用SPSS 11．0進行主成分分析
五、應用PAST 2．17進行主成分分析
六、應用PCORD進行主成分分析
第四節 主坐標排序
一、方法介紹
二、應用PAST進行主坐標排序
第五節 對應分析和除趨勢對應分析
一、對應分析
二、除趨勢對應分析
三、應用PAST進行對應分析和除趨勢對應分析
四、應用PCORD進行對應分析和除趨勢對應分析
第六節 典範對應分析和除趨勢典範對應分析
一、典範對應分析
二、除趨勢典範對應分析
三、應用PAST進行典範對應分析
四、應用Canoco進行典範對應分析和除趨勢典範對應分析
五、應用PCORD進行典範對應分析和除趨勢典範對應分析
第七節 無度量多維標定排序
一、方法
二、應用PAST和PCORD進行無度量多維標定排序
第十一章 生理生態學中數據統計分析
第一節 單因素方差分析
第二節 雙因素方差分析
第三節 獨立樣本￡檢驗和成對樣本￡檢驗
一、獨立樣本￡檢驗
二、成對樣本￡檢驗
第四節 重復測量數據的方差分析
第五節 實驗結果的圖表形式
一、三線表
二、應用Excel作圖的技巧
第十二章 應用R語言進行生態數據分析
第一節 R語言簡介
一、R語言的下載和安裝
二、R程序的一般運行方法
三、R語言中的基本語句
四、R語言中重要的生態與環境統計學程序包
第二節 數據標準化程序
第三節 二元數據的相似繫數矩陣程序
第四節 圖解相關繫數矩陣的程序
一、程序
二、運算結果
第五節 用R語言計算物種多樣性指數
一、a多樣性的計算
二、β多樣性計算程序
第六節 應用R語言進行數量分類
一、建立相異繫數矩陣的程序
二、構建聚類樹的程序
三、圓形聚類樹狀圖的方法
四、聚類和熱圖的構建方法
五、*小生成樹
第七節 應用R語言進行多元回歸樹構建
第八節 C一均值模糊聚類分析
第九節 應用R語言進行生態位分析
第十節 應用R語言進行排序分析
一、排序程序
二、組合聚類和排序的方法
三、典範對應分析、對應分析、除趨勢對應分析和約束排序分析程序
四、非度量多維標定
五、偏約束排序分析
第十一節 R語言在構建決策樹模型中的應用
第十二節 應用R語言繪制圖形的方法介紹
一、基本作圖語句
二、用R語言生成熱圖
三、排序二維散點圖
四、排序的三維散點圖
參考文獻
有關軟件的參考文獻