方玄昌主編的《轉基因真相中的真相》收集的70餘篇文章（參見目錄）選自《基因農業網》成立以來發表的數千篇報道、評論及科普文章，從公眾目前對轉基因已經存在的種種情緒和誤解入手，單刀直入地解答公眾的擔心、疑慮和質疑。內容涉及：（1）究竟什麼是轉基因？它與常規育種技術有沒有本質區別？轉基因真的會“轉”你的基因嗎？它究竟安全與否？（2）轉基因會給環境生態帶來災難嗎？（3）我們為什麼要使用轉基因技術？（4）種種關於轉基因有害的說法究竟是怎麼來的？為什麼會有那麼大的一個財團反對轉基因？支持轉基因的群體真的存在陰謀和利益問題嗎？（5）中國又為什麼遲遲不批準新的品種？（6）發展轉基因，我們的糧食安全、技術專利真的會掌握在外國公司手中嗎？（7）未來轉基因技術將給人類帶來怎樣的變化？（8）轉基因為什麼會遭到如此多的反對？它是怎樣一步步成為“問題”的？

序言：我們都該看看這本書
前言：反轉鬧劇的遺產
第一章 是與非
科學大爭論一一轉基因作物安全嗎?
反轉人士的常用策略
化學農藥與轉基因殺蟲蛋白的比較
談談美國的轉基因玉米
轉基因食品安全有共識
從美國轉基因大豆流向看其安全性
中國農業生物育種彷徨在十字路口
植物小RNA進入血液，驚世發現還是南柯一夢?
妖魔化轉基因的罪與罰
透視塞拉利尼的新“成果”
第二章 謠言與真相
謠言地圖：反轉謠言的來龍去脈
轉基因研究中八個“安全性事例”分析
反轉控公然篡改美國**科學院報告
謠言造成轉基因恐慌
美國在全面反思轉基因技術嗎?
“美國人不喫轉基因玉米”的謠言可休矣
再說說美國人喫不喫轉基因玉米
印度棉農為何自殺
美國不種轉基因小麥的原因
轉基因玉米滅*帝王斑蝶?
造謠無助於中國大豆種植業
歐盟禁止轉基因產品嗎?
轉基因拯救了阿根廷農業
第三章 科學的態度
讓科學回歸科學
情緒渲染和鬥爭精神
我為以前反對轉基因的行為道歉
轉基因需要標識嗎?
美國科學促進會理事會關於轉基因食品標識的聲明
歐洲正在錯失轉基因良機
轉基因科普是一場科學啟蒙
轉基因品嘗的科學依據
不再作沉默的大多數
我為什麼去品嘗轉基因大米
我為什麼支持轉基因
參加轉基因大米品嘗會的理由
品嘗活動是*好的科普
“知情”與“愚昧”的衝突與選擇
轉基因與科學中的民主
標識轉基因與標識DNA一樣毫無必要
轉基因問題中的人性
食品監管不可能用藥品標準
第四章 轉基因造就美好生活
轉基因面向未來
轉基因推動生物起源與進化
我們為什麼需要轉基因
轉基因木瓜的由來
轉基因番木瓜*安全
“黃金大米”，一個世紀以來*偉大的發明之一
國產大豆產業為什麼會崩潰
為什麼要研制植酸酶玉米
玉米的身世
談談綠色**稻
阻擋轉基因將成為歷史罪人
轉基因育種能帶來什麼
為何雜交落伍了?
紅藷：天然轉基因八千年
轉基因為何*環保?
從進口大豆數量看中國糧食短缺問題
**的“**土豆”
****商業化轉基因茄子
轉基因作物越來越有益於農民和環境
轉基因作物增產增收並減少農藥用量
轉基因的可持續性優勢
第五章 轉基因知識問答
科學基礎問題
食用安全問題
環境安全問題
基本事實
經濟問題
監管與標識
信仰、政治及其他
輿論、謠言與科普
另類問題的另類回答
後記：告別偏見，走向科學