華南濱海花崗岩小流域地下水流過程中因為人類
活動的影響體現出微生物類群有所差異。雖然隨著深
度的增加，溫度和壓力的改變，原始繼承性活性有機
碳在逐漸消耗而減少，但微生物仍然生長旺盛且種群
多樣。在地下水與河道水交互作用方面，淺層潛水與
地表非飽和帶聯繫密切，受地表水與雨水補給，一般
為氧化環境，其中微生物特性與下遊河道水相似。處
於花崗岩破碎帶的基岩裂隙水，其相應的微生物特征
與上遊河道水有較大的相似性。處於裂隙發育但破碎
層較少的基岩裂隙水，其承壓含水層受補給源控制水
量不夠豐足，處於還原環境，各種芽孢杆菌占絕對優
勢。在地下水與海水交互作用方面，海一陸交錯帶地
下水微生物優勢類群與附近海水的微生物優勢類群具
有很高的相似性。
不依賴培養的分子生物學方法應用於界面水文的
研究在國內相對較少，本研究在環境規劃、疾病控制
及城市水資源規劃等方面有實際意義，對於水文一微
生物交叉學科的發展有理論意義。黃小蘭編著的《華
南濱海小流域水文界面過程中的微生物時空變化》主
要供地理學、生態學、微生物學專業的本科生、研究
生及科研人員參考使用。

第1章 緒論
1.1 研究背景及意義
1.1.1 研究背景
1.1.2 研究意義
1.2 **外研究進展
1.2.1 小流域水文界面過程研究
1.2.2 分子生物學方法的研究進展
1.2.3 小流域地下水與微生物相互作用的研究進展
1.2.4 人類活動影響下的水體微生物研究
1.3 研究內容與技術路線
1.3.1 研究內容
1.3.2 技術路線
第2章 研究區概況
2.1 自然地理概況
2.1.1 地形、地貌
2.1.2 氣候特征
2.1.3 生物資源
2.2 水文地質背景
2.2.1 地質構造
2.2.2 河流水繫
2.2.3 地下水補給、徑流、排洩條件
2.3 社會經濟發展概況
2.3.1 行政區劃
2.3.2 人口現狀
2.3.3 經濟發展與土地利用
第3章 研究方法
3.1 材料
3.1.1 細胞株與質粒
3.1.2 試劑
3.1.3 培養基
3.1.4 主要儀器
3.1.5 實驗所用主要溶液
3.1.6 引物
3.1.7 樣品
3.2 方法
3.2.1 水樣微生物總DNA提取
3.2.2 16S rDNA的擴增及產物純化
3.2.3 16S rRNA基因的T載體連接
3.2.4 連接產物的轉化(含感受態細胞的制備)
3.2.5 陽性克隆篩選
3.2.6 ARDRA分型
3.2.7 16S rRNA序列的RFLP分析
3.2.8 序列比對和繫統發育分析
3.2.9 文庫分析
3.2.10 文庫保存
第4章 小流域地下水微生物空間變化與機理研究
4.1 微生物水平空間變化分析
4.1.1 水樣微生物總DNA提取
4.1.2 16S rRNA基因克隆文庫的分析
4.1.3 16S rRNA基因繫統發育樹的構建
4.2 水平空間變化機理分析
4.2.1 地下水水質
4.2.2 地下水化學離子類型
4.2.3 微生物類群的分布及其對水環境的響應
4.3 微生物垂向空間變化分析
4.3.1 樣品采集
4.3.2 微生物總DNA的提取結果
4.3.3 PCR擴增和基因組文庫的建立
4.3.4 ARDRA分析
4.3.5 基因繫統發育分析
4.3.6 微生物群落的垂向變化
4.4 垂向空間變化機理分析
4.5 小結
第5章 小流域地下水微生物時間變化與機理研究
5.1 短時間尺度微生物變化分析
5.1.1 旱季與雨季微生物類群比較
5.1.2 年度之間微生物類群比較
5.2 短時間尺度微生物16S rRNA基因演化分析
5.2.1 旱季與雨季微生物的基因繫統發育分析
5.2.2 年度間微生物的基因繫統發育分析
5.3 小流域主要離子變化分析
5.4 不同下墊面流域微生物變化分析
5.4.1 人類活動輕微擾動下的微生物特征
5.4.2 人類活動顯著擾動下的微生物特征
5.5 長時間尺度微生物16S rRNA基因演化分析
5.6 小結
第6章 地下水與地表水微生物的差異及其成因機理
6.1 微生物類群與多樣性分析
6.1.1 微生物優勢類群
6.1.2 微生物多樣性分析
6.1.3 繫統發育分析
6.2 成因機理分析
6.2.1 水文地質成因
6.2.2 化學離子成因
6.3 小結
第7章 地下水和海水微生物的環境適應與演化
7.1 入海通量分析
7.2 海水對地下水影響分析
7.3 地下水與海水微生物繫統發育分析
7.3.1 水樣微生物總DNA提取
7.3.2 16S rDNA序列的PCR擴增和純化
7.3.3 繫統發育樹的分析
7.4 微生物優勢類群及其成因
7.5 小結
第8章 結論與展望
8.1 主要結論
8.2 主要創新點
8.3 不足之處
8.4 展望
附錄1：縮略倒
附錄2：地下水16S rRNA基因的部分序列
附錄3：地表水16S rRNA基因的部分序列
附錄4：海水16S rRNA基因的部分序列
參考文獻
致謝