第1章 緒論
1.1 生物信息學的產生與發展
1.2 生物信息學的研究目的與研究內容
1.2.1 生物信息學研究目的
1.2.2 生物信息學研究內容
1.3 生物信息學在醫學中的應用
1.3.1 鋻定單基因疾病的關鍵致病基因
1.3.2 研究人類復雜疾病的發生機理
第2章 分子生物學數據庫
2.1 概述
2.2 核酸序列數據庫
2.2.1 GenBank數據庫
2.2.2 歐洲核酸檔案
2.3 蛋白質序列數據庫
2.3.1 PIR數據庫
2.3.2 Swiss-Prot數據庫
2.3.3 UniProt數據庫
2.4 蛋白質結構數據庫
2.4.1 蛋白質結構數據庫PDB
2.4.2 蛋白質結構分類數據庫SCOP
2.4.3 蛋白質二級結構數據庫DSSP
2.5 其他分子生物學數據庫
第3章 序列比對
3.1 序列比對基礎
3.1.1 序列比對的分類
3.1.2 序列的相似性
3.1.3 序列比對的打分矩陣
3.1.4 序列比對的空位罰分
3.2 雙序列比對
3.2.1 概述
3.2.2 點陣法
3.2.3 動態規劃法
3.2.4 BLAST算法
3.3 多序列比對
3.3.1 概述
3.3.2 SP模型
3.3.3 動態規劃法
3.3.4 星形比對算法
3.3.5 CLUSTAL w算法
第4章 核酸序列分析
4.1 DNA序列信息分析
4.1.1 DNA序列的基本信息
4.1.2 DNA序列的特征信息
4.2 基因組結構注釋分析
4.2.1 重復序列分析
4.2.2 基因識別
4.3 RNA序列分析
4.3.1 mRNA可變剪接分析
4.3.2 miRNA與靶基因預測分析
第5章 基因組功能注釋分析