《針灸大成》包含甚廣,內容涉及針灸學術各個方面,其主要內容如下:卷一是全書的理論基礎和指導思想,摘錄了《內經》、《難經》等書的針灸理論,並介紹了本書援引的二十多部針灸醫籍的簡要情況及評述;卷二、卷三為針灸歌賦和楊氏編寫的“頭不多灸策”等四篇考卷;卷四為針法部分,介紹了《素問》、《靈樞》和有代表性的各種補瀉法,其中有楊家針刺手法的相關介紹和總結;卷五為時間配穴法及其應用,主要包括子午流注及靈龜、飛騰針法;卷六、卷七為經絡、經穴和經外奇穴;卷八介紹了各種病癥的主穴、配穴、處方;卷九論述了各科病癥治法、灸法及楊氏醫案;卷十為陳氏《小兒按摩經》。