●卷一
身部上
坐功卻病之法
八段錦導引法
起居飲食之節
養老延年之方
服松脂法
服桑椹法
服雞子丹法
蒼龍養珠萬壽紫靈丹
九轉長生神鼎玉液膏
《太清經》說神仙靈草
菖蒲服食法
枸杞茶
鐵甕先生瓊玉膏
地仙煎
金水煎
服食茯苓法
服食術法
服食黃精法
服食萎雅法
服食巨勝法
神仙餌蒺藜方
紫霞杯方
河上公服芡實散方
身部下
髭須
發愛
亂發
頭垢
……
卷二
卷三
卷四
卷五
卷六
校後記

《山居本草》全書收藥1333種，其中，常見藥物593種、附品720種、人體身部藥20種。每藥列入正名、別名、鋻別、炮制、性味、功能主治、用法、宜忌、附方等項。卷後列辨藥八法，是一部集本草和養生於一體的綜合性本草著作，對養生保健與食療有一定參考價值。