《治水筌蹄》是16世紀治理黃河、運河的水利名著。“筌蹄”出典於《莊子。外物》,原指漁獵工具。治水筌蹄意思為治水工具書。成書當在其任職期內。原書由148條單篇短文結集而成。該書搜集、實踐治黃方略和方法,總結出築堤束水衝沙深河的經驗,後經潘季馴等繼承發展成為束水攻沙的理論和措施;首次提出汛前在河灘築矮堤,汛期用來滯洪攔沙,落淤灘地,穩定主槽;強調掌握汛情的必要性;建立上起潼關、下至宿遷的飛馬報汛制度;具體描述黃河暴漲暴落特性,對京杭運河,特別在山東境內,創造性地總結出一套因時因地制宜的航運管理與水量調節的操作方法。