紅山文化是軒轅黃帝宣揚、**的文化，本質是中國傳統文化。尹國興編著的這本《紅山密碼》將紅山文化與中國傳統文化有機結合，在中國傳統科學和傳統文化的大背景下，闡述牛河梁大遺址的重要意義。全書分為緒論、五個篇章和附錄。緒論是對牛河梁大遺址及其壇、廟、塚的天文地理關繫的整體介紹。五個篇章是牛河梁大遺址的分類介紹，包括牛河梁的星像、祭壇、神廟、積石塚群，牛河梁與《山海經》的關繫，出土玉器以及傳世的民俗典故。附錄回答了與牛河梁有關的一些問題。《山海經》中與牛河梁直接有關的記載數十條，本書按照漢語拼音順序將其排列成文。

前言
緒論
第一篇 牛河梁的星像
龍頭上的祭壇
織女星的山梁
軒轅黃帝：位在牽牛
子星和孫星
神龜和媵蛇
高昂的蛇頭
龜首上的離婁塚
龜背上的炎帝陵
東方七宿：黃帝的戰將
營室之官
天地之中
定之方中
農正稷星之所
帝舜的北鬥七星
天極繫鬥
玉衡之位的皋陶
天璣、天璇和天權
“轉山子”與天樞
辰星大火
兩隻鳥的叢林
東壁：天帝的書櫥
天弁：發明帽子的人
天目司察
幽都輿鬼之國
危宿是貳負之臣
登高望遠的南天門
天桔：天帝的侍衛
靠近蛇尾的天困
第二篇 祭壇、神廟和積石塚群
神廟的形成和認定
女神廟是蠶神廟
嫫母的頭像
東山嘴的龍王廟
龍角上的應龍
東山嘴的“女媧像”
消失的大廟
玄器的墓志
地壇下的重黎
觀天測日的日者
長股之國
奇異的三頭人
一手拘纓
據比之尸
鑿齒與黑齒
移葬的“三身”
足在頭上的噓
……
第三篇 牛河梁與《山海經》
第四篇 牛河梁問玉
第五篇 牛河梁民俗典故
附錄 牛河梁問答
參考文獻
後記