●實驗一 普通光學顯微鏡的使用
實驗二 培養基的制備與滅菌
實驗三 空氣微生物檢測
實驗四 水中細菌總數的測定
實驗五 芽孢杆菌生長曲線的測定
實驗六 土壤微生物的分離及計數
實驗七 細菌、放線菌、真菌菌落形態的顯微觀察與計數
實驗八 微生物純種的分離、接種及培養
實驗九 超積累植物內生真菌的分離及抗性測定
實驗十 芽孢杆菌的制片及革蘭氏染色
實驗十一 環境因子對微生物生長的影響
實驗十二 富營養水體中藻類葉綠素a含量的測定
實驗十三 澱粉酶和過氧化氫酶活性的測定
實驗十四 污染土壤環境中功能微生物的分離、篩選及馴化
實驗十五 功能微生物菌株對鎘的吸附
實驗十六 水樣中BOD5的測定
實驗十七 紫外線殺菌效果的檢測
實驗十八 實驗室酸牛乳發酵及指標檢測
實驗十九 CTAB法提取DNA
實驗二十 DNA和RNA濃度檢測
實驗二十一 蛋白質濃度測定（雙縮脲法）
實驗二十二 EPS提取與測定
附錄一 常用玻璃器皿的洗滌、干燥與包扎
附錄二 常用培養基的配方
附錄三 常用試劑和溶液的配制
附錄四 常用菌種的保藏方法

龍建友、閻佳主編的《環境工程微生物實驗教程》的實驗大致可以分為三類：第一類為基礎性實驗，目的是加強學生對微生物概念及基本理論知識的掌握和理解，如普通光學顯微鏡的使用、培養基的制備與滅菌等；第二類為綜合性實驗，目的是提高學生的實際操作能力，培養學生理論聯繫實際及發現問題、分析問題和解決問題的能力，如空氣微生物檢測、水中細菌總數的測定、土壤微生物的分離及計數等；第三類為研究性實驗，目的是培養學生的主動創新和解決實際科學問題的能力，如污染土壤環境中功能微生物的分離、篩選及馴化，功能微生物菌株對鎘的吸附，實驗室酸牛乳發酵及指標檢測等。
本書可作為高等院校環境工程、環境監測、資源與環境等專業的學生教材，也可供相關專業研究人員及實驗技術人員參考。