第1章 引言
1.1 研究背景和意義
1.2 **外研究進展
1.2.1 駱駝科動物的進化
1.2.2 現存駱駝科動物的生物學特性
1.2.3 生物信息學及其發展歷史
1.2.4 基因組測序技術
1.3 研究內容
第2章 駱駝科動物全基因組序列的測序與組裝
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗材料
2.1.2 DNA提取及檢測
2.1.3 基因組測序
2.1.4 測序數據過濾
2.1.5 K-mer分析估計基因組大小
2.1.6 小片段數據糾錯
2.1.7 駱駝科動物基因組的組裝
2.1.8 駱駝科動物基因組的測序效果評價
2.2 結果與分析
2.2.1 DNA樣品檢測結果
2.2.2 基因組測序結果
2.2.3 測序數據過濾結果
2.2.4 K-mer分析估計基因組大小的結果
2.2.5 小片段數據糾錯的結果
2.2.63 個駱駝科動物基因組的組裝結果
2.2.73 個駱駝科動物基因組的組裝後基因組分析
2.3 討論
2.3.1 測序物種的選擇
2.3.2 測序平臺與策略
2.3.3 基因組大小的估計
2.3.4 基因組的組裝指標
2.4 本章小結
第3章 駱駝科動物的基因組注釋
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗材料
3.1.2 重復序列注釋
3.1.3 基因預測
3.1.4 功能注釋
3.1.5 ncRNA注釋
3.1.6 基因集評估
3.1.7 直繫同源關繫分析
3.2 結果與分析
3.2.1 重復序列注釋統計結果
3.2.2 基因預測統計結果
3.2.3 功能注釋統計結果
3.2.4 ncRNA注釋統計結果
3.2.5 基因集評估統計結果
3.2.6 直繫同源關繫分析結果
3.3 討論
3.3.1 駱駝科動物基因組重復序列的注釋