●卷首
本草衍義補遺凡一百五十三種
新增補四十三種
十二經見證
足太陽膀胱經見證
足陽明胃經見證
足少陽膽經見證
手太陽小腸經見證
手陽明大腸經見證
足太陰脾經見證
足少陰腎經見證
足厥陰肝經見證
手太陰肺經見證
手少陰心經見證
手厥陰別脈經見證心主
手足陰陽經合生見證
論五篇
不治已病治未病
亢則害承乃制
審察病機無失氣宜
能合色脈可以萬全
治病必求於本
附：劉河間風熱濕燥寒論 出《宣明論》
附：《診家樞要》
附：十二經脈歌
附：古庵藥監
治風門升生
治熱門沉藏
治濕門中化
治燥門降收
治寒門浮長
治瘡門
卷之一
外感門上
中風一 附中氣 預防中風
預防中風新增 出《乾坤生意》
傷風二 冒風同治
中寒三
傷寒四 新增 附冒寒
溫熱病
冒寒新增
溫熱病新增 夏至前發
為溫夏至後發為熱謂之伏氣傷寒
溫熱病治例
卷之二
外感門下
中暑五 附暑風 注夏
暑病治例出《明醫雜著》
中濕六 陰濕熱
濕熱新增
溫疫七 附大頭病 鼕溫病 嶺南諸病 運氣證治
嶺南諸病新增 出《明醫雜著》
運氣證治新增 出《乾坤生意》
卷之三
內傷門 —
內傷八
傷食九
調補脾胃十 新增
卷之四
風門
破傷風十一
胃風十二
痛風十三 附肢節痛 肩背痛
肢節痛
肩背痛新增
痺十四 新增
癘風十五 附血風瘡 身上虛癢 癮疹
血風瘡新增
癮疹新增
卷之五
寒門
咳嗽十六 附肺痿 肺癰
咳嗽治例出《明醫雜著》
肺痿
肺癰
霍亂十七
卷之六
暑門
瘧十八
瘧疾治例出《明醫雜著》
痢十九
痢疾治例出《明醫雜著》
卷之七
濕門
痞二十
洩瀉二十一
洩瀉治例《出明醫雜著》
卷之八
濕熱門
吞酸二十二 附噯氣
疸二十三
水腫二十四
鼓脹二十五
赤白濁二十六
卷之九
痰門
痰二十七 附痰熱
痰飲治例出《明醫雜著》
痰熱新增
哮喘二十八
喘二十九
惡心三十
嘔吐三十一
咳逆三十二
翻胃三十三
嘈雜三十四
關格三十五
癭氣三十六
卷之十
痰熱門
痙三十七
痫三十八
顛狂三十九
驚悸怔忡四十
健忘四十一
纏喉風喉痺四十二 附咽
痛咽瘡
卷之十一
火門
火四十三 附風熱
風熱新增
吐血四十四
咳血四十五
嘔血四十六
咯血四十七 附痰涎血
衄血四十八
溺血四十九
下血五十—
腸風髒毒五十一
痔瘡五十二
漏瘡五十三
脫肛五十四
淋五十五
小便不通五十六
小便不禁五十七
夢遺五十八 附精滑
……
卷之十二
卷之十三
卷之十四
卷之十五
卷之十六
卷之十七
卷之十八
卷之十九
卷之二十
卷之二十一
卷之二十二
卷之十二
卷之二十四
附錄

《丹溪心法附餘》是明代有名醫家方廣器的著作，成書於明嘉靖十五1536年）。此書是方廣刪削《丹溪心法》中一些與朱丹溪學術理論相矛盾的“附錄”，另曾諸家方論於後，並附按語予以闡述，前後歷時五年編撰而成。